Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
EFNA1P20827 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EFNA1P20827 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EFNA1P20827 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms