Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNI3P19429 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNI3P19429 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TNNI3P19429 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms