Protein–RNA interactions for Protein: P14652

HOXB2, Homeobox protein Hox-B2, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB2P14652 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXB2P14652 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXB2P14652 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXB2P14652 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXB2P14652 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms