Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
RARBP10826 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
RARBP10826 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARBP10826 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARBP10826 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARBP10826 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RARBP10826 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARBP10826 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARBP10826 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARBP10826 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARBP10826 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RARBP10826 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RARBP10826 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RARBP10826 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RARBP10826 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RARBP10826 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARBP10826 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARBP10826 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARBP10826 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARBP10826 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RARBP10826 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RARBP10826 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RARBP10826 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARBP10826 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARBP10826 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARBP10826 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARBP10826 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RARBP10826 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RARBP10826 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARBP10826 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARBP10826 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARBP10826 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RARBP10826 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARBP10826 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARBP10826 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARBP10826 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARBP10826 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARBP10826 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RARBP10826 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RARBP10826 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RARBP10826 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARBP10826 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARBP10826 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RARBP10826 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RARBP10826 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RARBP10826 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RARBP10826 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RARBP10826 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RARBP10826 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARBP10826 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RARBP10826 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RARBP10826 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RARBP10826 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
RARBP10826 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARBP10826 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARBP10826 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARBP10826 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RARBP10826 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RARBP10826 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARBP10826 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RARBP10826 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARBP10826 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARBP10826 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARBP10826 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARBP10826 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RARBP10826 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARBP10826 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARBP10826 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARBP10826 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARBP10826 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RARBP10826 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
RARBP10826 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARBP10826 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RARBP10826 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms