Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP3P10745 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP3P10745 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RBP3P10745 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP3P10745 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP3P10745 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP3P10745 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP3P10745 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RBP3P10745 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP3P10745 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP3P10745 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RBP3P10745 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP3P10745 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP3P10745 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP3P10745 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP3P10745 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RBP3P10745 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBP3P10745 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RBP3P10745 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP3P10745 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP3P10745 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP3P10745 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RBP3P10745 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP3P10745 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP3P10745 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP3P10745 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP3P10745 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP3P10745 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RBP3P10745 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP3P10745 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP3P10745 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RBP3P10745 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP3P10745 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RBP3P10745 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP3P10745 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP3P10745 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP3P10745 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RBP3P10745 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RBP3P10745 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RBP3P10745 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RBP3P10745 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RBP3P10745 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP3P10745 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP3P10745 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP3P10745 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP3P10745 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RBP3P10745 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RBP3P10745 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP3P10745 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP3P10745 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP3P10745 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP3P10745 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP3P10745 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RBP3P10745 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RBP3P10745 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP3P10745 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP3P10745 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RBP3P10745 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP3P10745 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP3P10745 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP3P10745 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP3P10745 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP3P10745 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RBP3P10745 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms