Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CALM3P0DP25 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CALM3P0DP25 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CALM3P0DP25 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CALM3P0DP25 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CALM3P0DP25 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms