Protein–RNA interactions for Protein: P04844

RPN2, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPN2P04844 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPN2P04844 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPN2P04844 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPN2P04844 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPN2P04844 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RPN2P04844 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPN2P04844 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPN2P04844 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPN2P04844 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPN2P04844 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPN2P04844 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPN2P04844 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPN2P04844 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPN2P04844 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPN2P04844 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPN2P04844 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPN2P04844 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RPN2P04844 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPN2P04844 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPN2P04844 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPN2P04844 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN2P04844 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN2P04844 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN2P04844 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN2P04844 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPN2P04844 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN2P04844 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN2P04844 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN2P04844 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN2P04844 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPN2P04844 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPN2P04844 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPN2P04844 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN2P04844 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN2P04844 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN2P04844 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN2P04844 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPN2P04844 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN2P04844 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN2P04844 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN2P04844 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN2P04844 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPN2P04844 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN2P04844 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN2P04844 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN2P04844 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN2P04844 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPN2P04844 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPN2P04844 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN2P04844 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN2P04844 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPN2P04844 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN2P04844 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RPN2P04844 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN2P04844 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN2P04844 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN2P04844 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN2P04844 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPN2P04844 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN2P04844 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPN2P04844 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPN2P04844 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RPN2P04844 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN2P04844 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN2P04844 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN2P04844 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPN2P04844 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPN2P04844 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPN2P04844 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPN2P04844 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPN2P04844 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RPN2P04844 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPN2P04844 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPN2P04844 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPN2P04844 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPN2P04844 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPN2P04844 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPN2P04844 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RPN2P04844 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPN2P04844 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPN2P04844 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPN2P04844 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPN2P04844 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPN2P04844 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPN2P04844 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPN2P04844 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
RPN2P04844 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RPN2P04844 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPN2P04844 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPN2P04844 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPN2P04844 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPN2P04844 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPN2P04844 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPN2P04844 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms