Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRM2P04554 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PRM2P04554 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PRM2P04554 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRM2P04554 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRM2P04554 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRM2P04554 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRM2P04554 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRM2P04554 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRM2P04554 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PRM2P04554 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRM2P04554 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRM2P04554 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRM2P04554 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PRM2P04554 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRM2P04554 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRM2P04554 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRM2P04554 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRM2P04554 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRM2P04554 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PRM2P04554 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRM2P04554 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRM2P04554 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRM2P04554 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRM2P04554 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PRM2P04554 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRM2P04554 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
PRM2P04554 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PRM2P04554 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PRM2P04554 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRM2P04554 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRM2P04554 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRM2P04554 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PRM2P04554 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PRM2P04554 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PRM2P04554 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRM2P04554 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms