Protein–RNA interactions for Protein: O95749

GGPS1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1O95749 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GGPS1O95749 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
GGPS1O95749 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GGPS1O95749 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GGPS1O95749 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GGPS1O95749 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms