Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BANF1O75531 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BANF1O75531 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BANF1O75531 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BANF1O75531 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
BANF1O75531 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
BANF1O75531 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BANF1O75531 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BANF1O75531 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
BANF1O75531 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
BANF1O75531 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BANF1O75531 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BANF1O75531 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BANF1O75531 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BANF1O75531 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BANF1O75531 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BANF1O75531 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BANF1O75531 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BANF1O75531 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BANF1O75531 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BANF1O75531 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BANF1O75531 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BANF1O75531 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.5 ms