Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KERAO60938 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KERAO60938 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KERAO60938 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KERAO60938 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KERAO60938 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KERAO60938 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KERAO60938 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KERAO60938 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KERAO60938 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
KERAO60938 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KERAO60938 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KERAO60938 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KERAO60938 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
KERAO60938 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KERAO60938 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KERAO60938 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KERAO60938 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KERAO60938 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KERAO60938 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KERAO60938 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KERAO60938 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KERAO60938 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KERAO60938 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KERAO60938 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KERAO60938 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms