Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRAMEF10O60809 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRAMEF10O60809 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF10O60809 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF10O60809 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms