Protein–RNA interactions for Protein: O43674

NDUFB5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 5, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFB5O43674 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFB5O43674 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFB5O43674 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFB5O43674 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFB5O43674 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms