Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KDM6AO15550 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
KDM6AO15550 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM6AO15550 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
KDM6AO15550 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
KDM6AO15550 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms