Protein–RNA interactions for Protein: H7C0S8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0S8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H7C0S8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H7C0S8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H7C0S8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H7C0S8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0S8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0S8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H7C0S8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H7C0S8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H7C0S8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0S8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0S8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0S8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H7C0S8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H7C0S8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0S8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0S8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0S8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0S8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0S8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H7C0S8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0S8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0S8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0S8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0S8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0S8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H7C0S8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0S8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0S8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
H7C0S8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H7C0S8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H7C0S8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H7C0S8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
H7C0S8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
H7C0S8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0S8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0S8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H7C0S8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0S8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0S8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0S8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
H7C0S8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H7C0S8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H7C0S8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
H7C0S8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H7C0S8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H7C0S8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H7C0S8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H7C0S8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
H7C0S8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
H7C0S8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H7C0S8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H7C0S8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
H7C0S8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H7C0S8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H7C0S8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H7C0S8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H7C0S8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
H7C0S8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H7C0S8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H7C0S8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H7C0S8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H7C0S8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H7C0S8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
H7C0S8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H7C0S8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.5 ms