Protein–RNA interactions for Protein: H0Y7S4

PRAMEF26, Putative PRAME family member 26, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF26H0Y7S4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF26H0Y7S4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF26H0Y7S4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF26H0Y7S4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF26H0Y7S4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms