Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HNRNPCL3B7ZW38 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HNRNPCL3B7ZW38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HNRNPCL3B7ZW38 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HNRNPCL3B7ZW38 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HNRNPCL3B7ZW38 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms