Protein–RNA interactions for Protein: A6BM72

MEGF11, Multiple epidermal growth factor-like domains protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF11A6BM72 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MEGF11A6BM72 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MEGF11A6BM72 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
MEGF11A6BM72 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms