Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FRMD3A2A2Y4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FRMD3A2A2Y4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FRMD3A2A2Y4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FRMD3A2A2Y4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FRMD3A2A2Y4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms