Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WUU8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087WUU8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
A0A087WUU8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A087WUU8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
A0A087WUU8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
A0A087WUU8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms