Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
LRP12Q9Y561 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
LRP12Q9Y561 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
LRP12Q9Y561 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LRP12Q9Y561 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms