Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRG3Q9Y2Y8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRG3Q9Y2Y8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRG3Q9Y2Y8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRG3Q9Y2Y8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms