Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FAN1Q9Y2M0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FAN1Q9Y2M0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FAN1Q9Y2M0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FAN1Q9Y2M0 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FAN1Q9Y2M0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms