Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PTBP2Q9UKA9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTBP2Q9UKA9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTBP2Q9UKA9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTBP2Q9UKA9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms