Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK97

FBXO9, F-box only protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO9Q9UK97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FBXO9Q9UK97 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FBXO9Q9UK97 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FBXO9Q9UK97 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO9Q9UK97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO9Q9UK97 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FBXO9Q9UK97 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms