Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GTF2IRD1Q9UHL9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GTF2IRD1Q9UHL9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms