Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC7

GALP, Galanin-like peptide, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALPQ9UBC7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GALPQ9UBC7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GALPQ9UBC7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GALPQ9UBC7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GALPQ9UBC7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms