Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWM3

CUEDC1, CUE domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUEDC1Q9NWM3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CUEDC1Q9NWM3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CUEDC1Q9NWM3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CUEDC1Q9NWM3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUEDC1Q9NWM3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUEDC1Q9NWM3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUEDC1Q9NWM3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUEDC1Q9NWM3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CUEDC1Q9NWM3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CUEDC1Q9NWM3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms