Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FBXO28Q9NVF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FBXO28Q9NVF7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FBXO28Q9NVF7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FBXO28Q9NVF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
FBXO28Q9NVF7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms