Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
GJB4Q9NTQ9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
GJB4Q9NTQ9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
GJB4Q9NTQ9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
GJB4Q9NTQ9 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
GJB4Q9NTQ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 274.2 ms