Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS62

THSD1, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD1Q9NS62 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
THSD1Q9NS62 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
THSD1Q9NS62 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
THSD1Q9NS62 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THSD1Q9NS62 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.2 ms