Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ1

MKKS, McKusick-Kaufman/Bardet-Biedl syndromes putative chaperonin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKKSQ9NPJ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MKKSQ9NPJ1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MKKSQ9NPJ1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKKSQ9NPJ1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MKKSQ9NPJ1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MKKSQ9NPJ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.8 ms