Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP55

BPIFA1, BPI fold-containing family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA1Q9NP55 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
BPIFA1Q9NP55 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BPIFA1Q9NP55 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BPIFA1Q9NP55 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BPIFA1Q9NP55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms