Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRK3

MXRA8, Matrix remodeling-associated protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA8Q9BRK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MXRA8Q9BRK3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MXRA8Q9BRK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MXRA8Q9BRK3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MXRA8Q9BRK3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MXRA8Q9BRK3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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