Protein–RNA interactions for Protein: Q96T23

RSF1, Remodeling and spacing factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSF1Q96T23 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC45.31■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC45.3■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC45.28■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC45.26■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
RSF1Q96T23 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC45.23■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC45.23■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC45.21■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC45.2■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC45.19■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC45.19■■■■■ 4.83
RSF1Q96T23 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC45.18■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC45.17■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.15■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
RSF1Q96T23 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC45.09■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC45.09■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.81
RSF1Q96T23 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.05■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC45.05■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC45.04■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC45.03■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
RSF1Q96T23 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC44.97■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC44.96■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.95■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
RSF1Q96T23 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC44.94■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.6 ms