Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT8

TUBGCP5, Gamma-tubulin complex component 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBGCP5Q96RT8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TUBGCP5Q96RT8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBGCP5Q96RT8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBGCP5Q96RT8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
TUBGCP5Q96RT8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBGCP5Q96RT8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms