Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS6

NUDCD1, NudC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD1Q96RS6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NUDCD1Q96RS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NUDCD1Q96RS6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NUDCD1Q96RS6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUDCD1Q96RS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms