Protein–RNA interactions for Protein: Q96QV1

HHIP, Hedgehog-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHIPQ96QV1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
HHIPQ96QV1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HHIPQ96QV1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HHIPQ96QV1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HHIPQ96QV1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms