Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CLUHP3Q96NS8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CLUHP3Q96NS8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CLUHP3Q96NS8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CLUHP3Q96NS8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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