Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NXNL1Q96CM4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXNL1Q96CM4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NXNL1Q96CM4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NXNL1Q96CM4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NXNL1Q96CM4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NXNL1Q96CM4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NXNL1Q96CM4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXNL1Q96CM4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXNL1Q96CM4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NXNL1Q96CM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXNL1Q96CM4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXNL1Q96CM4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NXNL1Q96CM4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms