Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TM4SF18Q96CE8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TM4SF18Q96CE8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM4SF18Q96CE8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM4SF18Q96CE8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms