Protein–RNA interactions for Protein: Q969E8

TSR2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSR2Q969E8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
TSR2Q969E8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
TSR2Q969E8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
TSR2Q969E8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
TSR2Q969E8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
TSR2Q969E8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms