Protein–RNA interactions for Protein: Q95460

MR1, Major histocompatibility complex class I-related gene protein, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MR1Q95460 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MR1Q95460 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MR1Q95460 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MR1Q95460 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MR1Q95460 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MR1Q95460 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MR1Q95460 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MR1Q95460 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MR1Q95460 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MR1Q95460 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MR1Q95460 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MR1Q95460 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MR1Q95460 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MR1Q95460 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MR1Q95460 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MR1Q95460 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MR1Q95460 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MR1Q95460 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MR1Q95460 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MR1Q95460 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MR1Q95460 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MR1Q95460 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MR1Q95460 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MR1Q95460 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MR1Q95460 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MR1Q95460 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MR1Q95460 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MR1Q95460 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MR1Q95460 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MR1Q95460 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MR1Q95460 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MR1Q95460 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MR1Q95460 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MR1Q95460 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MR1Q95460 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MR1Q95460 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MR1Q95460 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MR1Q95460 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MR1Q95460 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MR1Q95460 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MR1Q95460 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MR1Q95460 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MR1Q95460 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MR1Q95460 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MR1Q95460 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MR1Q95460 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MR1Q95460 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MR1Q95460 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MR1Q95460 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MR1Q95460 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
MR1Q95460 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MR1Q95460 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MR1Q95460 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MR1Q95460 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MR1Q95460 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MR1Q95460 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MR1Q95460 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MR1Q95460 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MR1Q95460 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MR1Q95460 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MR1Q95460 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MR1Q95460 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MR1Q95460 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MR1Q95460 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MR1Q95460 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MR1Q95460 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MR1Q95460 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MR1Q95460 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MR1Q95460 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MR1Q95460 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MR1Q95460 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MR1Q95460 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MR1Q95460 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MR1Q95460 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MR1Q95460 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MR1Q95460 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MR1Q95460 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MR1Q95460 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms