Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
BRF1Q92994 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BRF1Q92994 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
BRF1Q92994 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRF1Q92994 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRF1Q92994 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms