Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBE3

FNDC9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC9Q8TBE3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FNDC9Q8TBE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
FNDC9Q8TBE3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FNDC9Q8TBE3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FNDC9Q8TBE3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms