Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HJURPQ8NCD3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
HJURPQ8NCD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HJURPQ8NCD3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HJURPQ8NCD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HJURPQ8NCD3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms