Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC35.18■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ARHGEF28Q8N1W1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ARHGEF28Q8N1W1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
ARHGEF28Q8N1W1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ARHGEF28Q8N1W1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
ARHGEF28Q8N1W1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC34.95■■■■□ 3.18
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF28Q8N1W1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF28Q8N1W1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF28Q8N1W1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ARHGEF28Q8N1W1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
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