Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVV2

LOXHD1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,947 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXHD1Q8IVV2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LOXHD1Q8IVV2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LOXHD1Q8IVV2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LOXHD1Q8IVV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LOXHD1Q8IVV2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LOXHD1Q8IVV2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms