Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RSPH3Q86UC2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
RSPH3Q86UC2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RSPH3Q86UC2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH3Q86UC2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.5 ms