Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWN0

LYPD4, Ly6/PLAUR domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYPD4Q6UWN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
LYPD4Q6UWN0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LYPD4Q6UWN0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LYPD4Q6UWN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LYPD4Q6UWN0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 439.4 ms